Where an antigen sits (antigen compartmentalization) is known to influence how CD4 and CD8 T cells recognize it, but how it shapes immune responses to the…

Background: The Citrobacter genus harbors class C (AmpC) and class A β-lactamases. Citrobacter freundii produces an inducible AmpC β-lactamase controlled by the LysR-type transcriptional regulator Amp...

Author summary We hypothesize that immune system activation is linked to the development of Parkinson’s disease (PD). Previous work revealed that repeated gastrointestinal infections with Citrobacter ...

Researchers engineered a living Citrobacter sp. MICI21 biofilm on copper that outcompeted the corrosive sulfate-reducing bacterium Oleidesulfovibrio alaskensis G20 and formed a dense, mechanically coh...

Aislamiento, caracterización y eficacia in vitro del fago Citro-6 frente a la mastitis bovina inducida por Citrobacter freundii

Gut microbiota with co-abundant behaviors is considered belonging to the same guild in micro-ecosystem. In this study, we established co-abundance networks of operational taxonomic units (OTUs) among 2944 Chinese adults from the Shanghai Men’s and Women’s Health Studies and observed a positive connection-dominated scale-free network using Sparse Correlations for Compositional data (SparCC). The closeness centrality was negatively correlated with other degree-based topological metrics in the network, indicating the isolated modularization of the bacteria. A total of 130 guilds were constructed, with a high modularity of 0.68, and retaining more diversity of OTUs than genus classification. The scores of guild structure similarity for comparisons between all, the healthy and the unhealthy subjects were higher than those derived from randomized permutations, suggesting a robust guild structure. We further used the constructed 130 guilds as the aggregation units to identify gut microbiota that may be associated with type 2 diabetes, and found that the OTUs in 21 significant guilds relevant to diabetes belonged to 19 of 41 (46.3%) previously reported genera (derived from Disbiome database), while only 10 (24.4%) showed different abundances between diabetes patients and healthy subjects in genus-based analysis. Our study reveals modularization of gut microbiota as guilds in Chinese populations, and demonstrates advantages of guild-based analysis in identifying diabetes-related gut bacteria. The analytical method based on microbial networks should be widely used to deepen our understanding of the role of gut microbiota in human health.

Author summary We hypothesize that immune system activation is linked to the development of Parkinson’s disease (PD). Previous work revealed that repeated gastrointestinal infections with Citrobacter rodentium causes PD-like symptoms and immune cell invasion in the brain of Pink1 knockout (KO) mice. In the current study, we tested whether a single mild gut infection alters blood-brain barrier (BBB) permeability and causes brain inflammation. We infected Pink1 WT and KO mice with Citrobacter rodentium and used gadolinium-enhanced MRI to detect BBB permeability changes at 13- and 26-days post-infection. Results showed increased BBB permeability in specific brain regions at 26 days. While tight-junction and dopamine (DA)-related proteins remained unchanged, we observed altered expression of synaptic genes, chronic microglial activation, elevated inflammatory markers, and neutrophil infiltration in the brain. Our findings suggest that even mild gastrointestinal infections can increas

Shiga toxin (Stx)–producing Escherichia coli (STEC) colonizes the gut and causes enteritis through bacterial attachment-effacement (A/E), leading to mucosal damage. This facilitates systemic uptake of Stx, which can often lead to hemolytic-uremic syndrome (HUS) and acute renal failure, particularly in children <5 years of age. STEC infections expressing Stx2 variants are a major risk factor for HUS. Beyond patients receiving supportive care, there is no treatment for STEC-mediated HUS, and antibiotics are contraindicated. The 3- to 7-day prodromal interval between onset of STEC diarrhea and HUS offers a window for intervention for diarrheic patients, contacts thereof, or individuals exposed to the source of infection.MethodsCitrobacter rodentium (Cr), a mouse pathogen that exhibits mucosal bacterial A/E, was genetically constructed to express Stx2d (Cr-Stx2d). This, along with a Cr parent strain carrying the kanamycin gene, were used to model STEC in mice. Mice were treated intraperitoneally with a broad subtype-specific, Stx-neutralizing nanobody multimer fused to the human IgG1 Fc domain (VNA2-Stx/hFc).ResultsWhen a single treatment was administered as late as 4 days after Cr-Stx2d challenge, likely within the human STEC-HUS window of intervention, complete protection of mice was achieved.ConclusionsThis Cr-Stx2d model, which mimics elements of human STEC infections by causing mucosal gut lesions and systemic Stx2d-mediated kidney damage, will help evaluate specific treatments against STEC-HUS, as demonstrated here with VNA2-Stx/hFc-treated mice given a single injection well after bacterial challenge. This product should be safe, simple, and economical to manufacture.

H-NS is an abundant nucleoid-associated protein found in Enterobacterales species. Some conjugative plasmids encode H-NS homologues, which are thought to facilitate plasmid maintenance and reduce the fitness costs associated with plasmid carriage. Here, we characterize HppXCROD2, an H-NS homologue encoded by the IncX4 plasmid pCROD2 of Citrobacter rodentium . Our data indicate that HppXCROD2 has a strong preference for binding pCROD2 over the chromosome or other plasmids. By contrast, chromosomally encoded H-NS displays no preference for plasmid sequence. When expressed from a heterologous plasmid in Escherichia coli , HppXCROD2 showed similar DNA-sequence preference to chromosomally encoded H-NS. Moreover, HppXCROD2 binding to a sequence from pCROD2 was much lower when that sequence was cloned in a laboratory plasmid. Thus, HppXCROD2 preferentially binds DNA in the context of the plasmid where it is encoded, a phenomenon we term “cognate plasmid specificity”. We propose that cognate plasmid specificity occurs through recognition of plasmid-specific DNA topology generated by plasmid-encoded topoisomerases. Cognate plasmid specificity may insulate regulation of plasmid genes from the effects of host DNA, while minimizing disruption of host chromosome regulation due to plasmid carriage.

Em agosto de 2025, pesquisadores da USP e do Instituto de Pesca de São Paulo publicaram estudo sobre a descoberta que deveria estar em todo noticiário de saúde pública: a bactéria Citrobacter telavivensis foi identificada pela primeira vez em alimentos no Brasil. Esta bactéria é classificada pela Organização Mundial da Saúde como de prioridade crítica em resistência a antibióticos. O alimento em questão eram ostras frescas, compradas em mercados de São Paulo e Santa Catarina. Nenhuma das amostras teria sido reprovada nos testes de inspeção sanitária vigentes. Uma ameaça que cresce silenciosamente A resistência antimicrobiana é reconhecida pela Organização Mundial da Saúde como uma das dez maiores ameaças à saúde global. Em outubro de 2025, o relatório GLASS da OMS revelou que uma em cada seis infecções bacterianas registradas entre 2018 e 2023 já apresentava resistência a antibióticos — um aumento de mais de 40% no período. Em maio de 2025, a Assembleia Mundial de Saúde aprovou um novo Plano Global de Ação para 2026–2036, em reconhecimento de que, sem intervenção, as superbactérias podem matar até 39 milhões de pessoas por ano até 2050. Esse número supera as projeções atuais de mortalidade por câncer. O problema, porém, ainda é narrado quase exclusivamente como uma questão hospitalar. O que os dados de 2025 reforçam é que elas chegaram à cadeia alimentar — e que a fiscalização sanitária brasileira ainda não acompanhou essa mudança. Ostras com a concha fechada, no fundo do mar Nadin Sh/Pexels Por que a ostra é um espelho do mar? Ostras são animais filtradores. Elas bombeiam água continuamente para se alimentar e retêm na microbiota tudo o que circula no ambiente onde crescem: vírus, metais pesados, resíduos de medicamentos e bactérias. Por isso, funcionam como sentinelas ambientais. O que está na água, está nelas. No estudo de 2025, as amostras continham não apenas a Citrobacter telavivensis — registrada pela primeira vez em um hospital israelense em 2010 — mas também cepas de Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli resistentes a antibióticos de última geração. Além disso, 35% das amostras apresentaram concentrações de arsênio acima do limite máximo permitido pela Anvisa. Os pesquisadores identificaram um fenômeno chamado co-seleção: o arsênio e os resíduos de antibióticos presentes na água selecionam, ao mesmo tempo, bactérias tolerantes aos dois. O ambiente poluído age como uma estufa de resistência. O protocolo que não foi feito para isso Quando um peixe ou um molusco chega a uma planta de processamento no Brasil, ele é avaliado por sistemas reconhecidos internacionalmente — HACCP, APPCC, Boas Práticas de Fabricação. Esses sistemas verificam temperatura, higiene, presença de microrganismos totais, ausência de patógenos específicos como Salmonella e Listeria. O que eles não verificam é o perfil de resistência antimicrobiana das bactérias encontradas. Um lote de peixe pode conter o Staphylococcus aureus resistente à meticilina, uma das superbactérias mais perigosas conhecidas — e ainda assim ser liberado para consumo se o número total de microrganismos estiver dentro da norma. Há uma razão técnica para isso: os protocolos foram desenhados antes de a resistência antimicrobiana se tornar um problema de escala na cadeia alimentar. Eles ainda estão atualizados para o problema de ontem. Biofilme: o escudo invisível das superbactérias Há um fator que torna o cenário ainda mais complexo. Bactérias como o Staphylococcus aureus resistente à meticilina não circulam apenas nos alimentos — elas colonizam equipamentos, bancadas e tubulações das próprias plantas de processamento. E fazem isso formando estruturas chamadas biofilmes. Um biofilme é uma comunidade bacteriana encapsulada em uma matriz protetora. Dentro dele, as bactérias são entre cem e mil vezes mais resistentes a antibióticos do que quando estão isoladas — e mais resistentes aos sanitizantes químicos usados nos processos de higiene industrial. Em pesquisa publicada em 2023 no periódico Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, juntamente com a equipe da professora Fernanda Sampaio Cavalcante (UFRJ-Macaé) demonstramos que uma enzima produzida naturalmente pela bactéria Staphylococcus lugdunensis — a lugdulisina — é capaz de inibir a formação de biofilmes do Staphylococcus aureus resistente à meticilina e destruir biofilmes já estabelecidos em laboratório. A lugdulisina é uma metaloprotease: ela degrada a matriz proteica que sustenta a estrutura do biofilme, desprotegendo as bactérias e tornando-as vulneráveis novamente. Até o momento trata-se de um resultado experimental, mas que aponta para uma direção perseguida por pesquisadores do mundo inteiro: agentes anti-biofilme de origem biológica como alternativa ou complemento aos sanitizantes químicos. O que falta fazer? O problema não tem solução única. Ele começa no uso de antibióticos na aquicultura e na pecuária. Mais de 75% dos antibióticos produzidos no mundo vão para animais. E atravessam o saneamento básico, o descarte de medicamentos, a fiscalização ambiental e os protocolos industriais. No Brasil, o Ministério da Agricultura implementou em 2023 a segunda etapa do Plano de Ação Nacional de Prevenção e Controle da Resistência aos Antimicrobianos no âmbito Agropecuário. O programa monitora Salmonella em aves, suínos e bovinos. Pescado (moluscos e peixes), no entanto, ainda não estão cobertos. Três mudanças são urgentes. A vigilância de resistência antimicrobiana precisa incluir o pescado. Os protocolos de qualidade alimentar precisam ser atualizados para contemplar rastreabilidade de origem e teste de perfil de resistência. E o financiamento para pesquisa de alternativas biotecnológicas — como enzimas anti-biofilme — precisa acompanhar a velocidade com que as bactérias evoluem. A superbactéria não tem preferência por hospital. Ela vai aonde a pressão seletiva a leva. E nos últimos anos, essa pressão foi para o mar. A presença de superbactérias em alimentos não apenas ameaça a saúde pública, mas também pode comprometer exportações brasileiras de pescado, já que mercados internacionais — especialmente União Europeia e Estados Unidos — exigem padrões rigorosos de controle de resistência antimicrobiana. Isso significa que, além do risco sanitário interno, há um risco direto para a competitividade do setor pesqueiro e para a economia nacional. *Leonardo Vazquez é pesquisador, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) Ana Lúcia do Amaral Vendramini´é Professora Titular da Escola de Química, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) Mais Lidas